天津生物芯片在《PNAS》上发表采油微生物基因组和重油降解分子机制研究-自主发布-资讯-生物在线

天津生物芯片在《PNAS》上发表采油微生物基因组和重油降解分子机制研究

作者:天津生物芯片技术有限责任公司 2008-07-16T00:00 (访问量:3382)

采油微生物基因组和重油降解分子机制研究

该研究成果于2007年3月在国际权威杂志《美国科学院院报》PNAS上发表,得到国内外同行的高度评价。该研究在MEOR(微生物提高石油采收率)和石油污染的生物治理两个方面均有着重大的意义,具有良好的应用前景。

基因组序列的破译和分析

 

l      全基因组序列测定:测序反应总计55727个,测序总量约33.5Mb。经拼接得到包含一个3.55Mb基因组染色体和一个57.7kb质粒的全序列,序列平均覆盖倍数为9.3倍。

l      全基因组注释:全基因组共编码基因3501个,平均长度870bp,占全基因组序列的84.49%;其中2563个基因有确定或假设的功能,938个基因功能未知;此外,基因组分别编码10个16S rRNA,10个23S rRNA, 87个tRNA。

成果总结:

(1)完成了NG80-2的全基因组破译和注释。

(2)综合利用生物信息学和功能基因组学方法,首次发现和鉴定了微生物的重质烷烃降解途径,对其中的关键酶—重质烷烃羟化酶基因的功能进行了全面的生化鉴定。

(3)比较基因组学分析显示NG80-2属于嗜热脱氮芽孢杆菌,在通过外源基因获得降解长链烷烃的能力之前可能是一种土壤菌。

(4)从系统生物学角度初步阐明了NG80-2在地下油藏特殊生存环境下的自身调控机制。

(5)预测和鉴定4个新的芳香烃降解途径; 鉴定了一批具有较高应用价值的耐热工业用酶。

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