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天津生物芯片-细菌基因组完成图测序进入新时代

作者:天津生物芯片技术有限责任公司 2013-09-21T23:32 (访问量:3201)

近期,天津生物芯片公司成功地引进了PacBio RS II测序平台,并与二代测序平台相结合,建立了细菌基因组完成图测序新策略。该策略使细菌基因组测序达到最快2周内完成测序和生物信息学分析,费用最低仅需4万元,一致性序列单碱基准确性99.999%以上的高水平,可以更好地致力于细菌基因组学研究!
适用范围
1. 普通细菌快速完成图测序;
2. GC异常细菌,如放线菌基因组完成图测序;
3. 具有较多异常结构及重复区细菌基因组测序;
4. 已完成基因组草图测序/精细图测序,希望进行Gaps填补获得完成序列的细菌。
服务特点
1、实验安排灵活、服务周期短、速度快、
天津生物芯片拥有自主的PacBio RS II测序平台可根据合作伙伴具体需要灵活安排实验。此外,首推的细菌基因组完成图测序新策略,进一步缩短了测序周期,最短2周内即可完成基因组测序和生物信息学分析;
2、测序结果准确性更高
细菌基因组完成图测序的新策略联合应用了PacBio RS II, Genome Analyzer IIx平台,结合数十年细菌基因组学研究的经验累积,多方面保证了拼接结果准确,一致性序列的准确性达99.999%以上,为合作伙伴提供最大程度的质量保障;
3、测序成本更低
测序新策略降低了测序试剂成本和人工成本,基因组完成图测序的成本更低,最低仅需4万元。
天津生物芯片已完成的项目
自2005年开始至今,天津生物芯片利用不同测序平台已经完成细菌基因组完成图测序超过100株,非完成图测序超过2000株,相关研究成果发表在Nature、PNAS、Genome Biology、Journal of Bacteria等权威期刊发表论文超过120篇。丰富的科研经验以及全新的测序策略,使天津生物芯片在环境细菌基因组学测序及分析方面处于国内**地位,可以更好地为合作伙伴的科研项目服务!

细菌基因组学研究部分文章列表:
1. Ram P Maharjan, Thomas Ferenci, Peter R Reeves, Yang Li, Bin Liu, and Lei Wang*. 2012. The multiplicity of divergence mechanisms in a single evolving population. Genome Biology. 13(6), R41.
2. Shumin Zhang, Yinghua Xu, Zhemin Zhou, Shaojing Wang, Ruifu Yang, Junzhi Wang,* Lei Wang*. Complete Genome Sequence of Bordetella pertussis CS, a Chinese Pertussis Vaccine Strain. Journal of Bacteriology. 2011, 193(15):4017-4018.
3. Qilong Qin, Yang Li, Yanjiao Zhang, Zhemin Zhou, Weixin Zhang, Xiulan Chen, Xiying Zhang, Baicheng Zhou, Lei Wang and Yuzhong Zhang*. 2011. Comparative genomics reveals a deep-sea sediment-adapted life style of Pseudoalteromonas sp. SM9913. ISME journal. 5(2),274-284.
4. Yang Li, Boyang Cao, Yongfu Zhang, Jiali Zhou, Bin Yang, Lei Wang*. 2011. Complete Genome Sequence of Staphylococcus aureus T0131, an ST239-MRSA-SCCmec type III Clone isolated in China. Journal of Bacteriology, 193(13),3411-3412.
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