在我们的肠道内“居住”着100万亿个微生物，其重量1.5-2 kg，分属于1000多个种，主要包括细菌和古细菌。这些肠道微生物参与到人类的代谢及免疫过程中。目前已有研究发现，肠道微生物与某些胃肠的疾病及代谢性疾病，如溃疡性结肠炎、糖尿病、肥胖症有重要关系。并且，肠道微生物的群落结构会随着人饮食、生活习惯的调整而变化，再反过来影响人体健康水平。

　　微基生物运用分子生物学结合高通量测序的方法，可以得到肠道中绝大部分微生物的信息，并通过生信/统计分析，对大量数据进行处理和分析，找到在肠道中与环境因子（疾病等）相关的微生物群落组成，从而达到预防疾病的发生的目的。

肠道微生态分析流程

• 样品采集及运送：

　　新鲜样品：≥ 2 g（约一节小拇指大小）。采集时应避免厕所污水及马桶上微生物的污染。可先收集于无菌的医用粪便收集器皿中，再转移到专用的无菌粪便采集管中。

　　DNA样品：样品需求量：≥ 300 ng；样品浓度：≥ 10 ng/μL；样品纯度：OD260/280=1.8-2.0并确保DNA无降解；

　　样品运送：干冰或冰袋保存寄运。

• 生信/统计分析

案例分析：

标题：巴布亚新几内亚人肠道微生物：组成，多样性及生态形成过程 （Cell Reports, IF: 8.358）

研究领域：肠道微生物

分析物种：细菌

高通量测序平台：Illumina MiSeq

测序区域：16S rRNA gene V5-V6 region

主要结果：

　　（1）PNG和US人群肠道微生物多样性分析

　　（2）细菌多样性图谱

　　（3）

　　（4）

原文链接： http://www.cell.com/cell-reports/abstract/S2211-1247(15)00340-Xv

参考文献：

　　Martinez, I., J. C. Stegen, M. X. Maldonado-Gomez, A. M. Eren, P. M. Siba, A. R. Greenhill and J. Walter (2015). “The gut microbiota of rural papua new guineans: composition, diversity patterns, and ecological processes.” Cell Rep 11(4): 527-538.